2015年，学校由原上海医药高等专科学校、上海医疗器械高等专科学校和上海健康职业技术学院合并组建而成。上海医药高等专科学校前身是1999年成立的上海第二医科大学卫生技术学院；上海医疗器械高等专科学校1960年由卫生部创建；上海健康职业技术学院前身是1950年成立的上海职工医学院。 [4]

据2020年4月学校官网显示，学院有北苑、南苑和新南苑三个校区，在校生1.5万余人，开设了16个本科专业和27个专科专业。截至2018年9月，与上海理工大学、上海中医药大学联合培养的研究生已有三届，硕博士共计177名。

上海健康医学院新校区和老校区均采用融靖电子的E-BOX信息发布系统，通过该系统可以快速将新闻信息、学院通知、宣传视频传递给师生。